实验室废水量少，间断性强，危害性高，污染物的组成不同，从而导致处理的原理和方法不同，因此，处理这类废水有一定难度。目前处理此类实验室污水比较成熟的方法有以下几种。
实验室污水处理絮凝沉淀法
此方法适用于含有重金属离子较多的无机实验废水。当确定了废水中的重金属离子后，选出合适的絮凝剂，比如石灰、铁盐、铝盐等，在弱碱性条件下可形成Mn(OH)2、Fe(OH)3、Al(OH)3等絮凝状沉淀，同时这些絮状沉淀也具有吸附作用，可以在去除重金属离子的同时，去除部分水中的其他污染物，降低水中化学需氧量，提高废水的可生化性。
实验室污水处理硫化物沉淀法
此方法主要针对含有镉、铅、汞等重金属较多的实验室污水，一般是用Na2S或NaHS把废水中的重金属转变为难溶于水的金属硫化物，再和Fe(OH)3共沉淀进行分离。具体做法：将废水的PH值调到8.0-10.0，向废水中加入过量的Na2S，使其生成硫化物沉淀，再加入FeSO4作为共沉淀剂，生成的FeS将水中悬浮的金属硫离子吸附而形成共沉淀，静置、分离并过滤。
