根据2015年8月20日教育部印发的《教育部重点实验室建设与运行管理办法》和《教育部重点实验室评估规则（2015年修订）》，教育部重点实验室定期评估主要对实验室5年的整体运行状况进行综合评估，评估程序分为初评、现场考察和综合评议三个阶段。教育部根据定期评估结果，对实验室进行动态调整。未通过评估的实验室不再列入教育部重点实验室序列；评估结果为优秀的实验室优先推荐申报国家重点实验室。
从本次2017年教育部重点实验室评估结果看，共有10个教育部重点实验室评估结果为优秀，41个实验室评估结果为良好。尽管教育部并未公布未通过重点实验室名单，不过根据教育部此前公布的参加初评和现场考察的重点实验室名单，可知共有5个实验室未通过定期评估。具体的评估结果如下：
