教育部重点实验室定期评估主要对实验室5年的整体运行状况进行综合评估，评估程序分为初评、现场考察和综合评议三个阶段。教育部根据定期评估结果，对实验室进行动态调整。未通过评估的实验室不再列入教育部重点实验室序列;评估结果为优秀的实验室优先推荐申报国家重点实验室。
根据教育部发布的通知，信息领域开放运行满3年的实验室均应参加定期评估。参加本年度评估的实验室59个。2017年实验室评估的初评拟于9月择期进行，现场考察拟于10月下旬进行，综合评议拟于11月下旬进行。
从2016年生命和医学领域教育部重点实验室评估结果来看，淘汰率还是非常高的。2016年参加评估的教育部重点实验室共有156个，其中就有14个实验室未通过定期评估，不再纳入教育部重点实验室序列，预计2017年也将会有实验室被淘汰。参加2017年评估的教育部重点实验室名单如下：
