根据实验动物微生物控制标准，可将实验动物分为四级：
一级 普通动物（CV），系指微生物不受特殊控制的一般动物。要求排除人兽共患病的病原体和积少数的实验动物烈性传染病的病原体。为防止传染病，在实验动物饲养和繁殖时，要采取一定的措施，应保证其用于测试的结果具有反应的重现性（即无论不同的操作人员，在不同的时间，用同一品系的动物按规定的实验规程所做的实验，都能获得几乎相同的结果）。
二级 清洁动物（CL），要求排除人兽共患病及动物主要传染病的病原体。
三级 无特殊病原体动物（SPF），要求到二级外，还要排除一些规定的病原体。其除菌与灭菌的方法，可使用高效空气过滤器除菌法、紫外线灭菌法、三甘醇蒸气喷雾法及氯化锂水溶液喷雾法。
四级 无菌动物（GF）或悉生动物（GN）。无菌动物要求不带有任何用现有方法可检出的微生物。悉生动物要求在无菌动物体上植入一种或数种已知的微生物。
在病理学检查上，四类实验动物也有不同的病理检查标准。
一级 外观健康，主要器官不应有病灶。
二级 除一级指标外，显微镜检查无二级微生物病原的病变。
三级 无特殊病原体动物。无二、三级微生物病原的病变。
四级 不含二、三级微生物病原的病变，脾、淋巴结是无菌动物组织学结构。
综合上述，对不同级别的实验动物在动物房设计上和管理上则有不同的要求。
无菌、已知菌以及无特殊病原体动物都需要在无菌或尽可能无菌的环境里饲养，这种环境，目前国际上通用称为屏障环境，即用一道屏障把动物与周围污染的环境隔开，就如胎鼠在母鼠子宫内一样。这种环境从控制微生物的角度分为隔离系统、屏障系统、半屏障系统、开放系统和层流架系统等五大类。
A 隔离系统
是在带有操作手套的容器中饲养动物的系统，用于饲养无菌动物和栖生动物。内部保持按微生物要求的100级的洁净度，但其设置的房间及操作人员不必按无菌室考虑。
B 屏障系统
把10000~100000级左右的无菌洁净室作为饲养室，主要用于无特殊病原体动物的长期饲养和繁殖。入室施行严格管理，如淋浴、换贴身衣服等。
C 半屏障系统
放宽对屏障系统中人及物出入房间时的管理，平面组成大致与屏障系统相同。
D 层流架系统
笼具放在洁净的水平层流空气中。常用于小规模饲养，但在一般房间进行饲养、操作和处理时有被污染的危险性。可用于半屏障的补充。
E 开放系统
是对人、物、空气等进出房间均不施行消除污染的系统，但通常要进行某种程度的清洁管理。
达到动物房环境指标的净化措施有：
A．空气净化系统
因为动物房是实验动物较长时间活动的场所，室内不可能在饲育条件下经常用薰蒸冲洗的方式灭菌，一般只能用药力较弱的消毒液檫洗，在这种情况下为了避免微生物侵染，保证空气净化则是首要条件；
B．全新风
防止交＊污染和除臭是两个难题，为此，净化空调系统大部分必须采用全新风方式，但由于净化系统换气次数大，又是全新风，所以能耗问题突出；
C．除臭
这不仅是对外部环境和工作人员所必须，而且也是实验动物本身所必须。因为室内除外界微生物污染外，动物本身排泄物和微生物二次转化生成的氨、硫化氢、醇等气体，也是重要的污染物质，这些气体臭味愈浓烈，说明动物本身的洁净度愈低。目前还无臭气允许值的定量资料和测定方法，但对于氨浓度应进行控制。除臭一般有增加新风和活性炭吸附两种方法。
动物房一般环境因子控制范围：
(1) 温度 目标值为21~27℃。药典规定为17~28℃。可因动物品种而不同。
(2) 湿度 45%~55%。卫生部规定为40%~60%。
(3) 气流速度 10~25cm/s。避免直接吹风。
(4) 换气次数 6~15次/h。新风为2/3。
(5) 气压 洁净区正压，感染区负压。
(6) 环境洁净级别 一般动物饲养室大于100000级。
(7) 照明 150~300lx（人工照明）。
(8) 噪音 40~50dB（无动物时），有动物时为60 dB，卫生部规定小于70 dB。 (9) 臭气 氨20ppm。
动物房设计的基本要求
(1) 选址 僻静、卫生
(2) 布置 分为准备区、饲养区、实验区。要求人流、物流、动物流分开（单向流程）；要求净化、灭菌、防虫。
(3) 建筑 要求有洁净走廊，饲养室，污染走廊以及其他各室。
(4) 空调系统 有可控制的温度和湿度、气流速度和分布，有一定的换气量和气压。
(5) 照明 无窗动物房使用荧光灯，有窗动物房可安装玻璃窗，以滤去紫外线。要求12h亮，12h暗。
(6) 供水 有饮用水和精制水。
四．动物房的设置
根据不同种类和不同级别实验动物的需要，建立相应设施的动物房、活动场所和相应的辅助用房。场址应选在能保持安静、清洁、无不良外界影响的地方。
动物房必须光线充足、通风良好、地面整洁，不积水；顶棚、墙壁要易于清洁、消毒；外墙、屋顶、顶棚、门窗及通外面的管道等必须杜绝外界动物、蚊蝇及其它虫害钻入。室内温度控制在18~29℃，相对湿度40%~70%，噪音60 dB以内。
笼内动物密度不能太大，要有送风、排风、降温及保暖设备。必须有专用的排污、排水设施，防止病原扩散。各种笼具要定期清洗消毒，垫料须经高温高压或药物消毒并及时更换，使室内氨浓度在15 mg/m3以下。
