陈国南表示，除了众所周知的微生物污染、食物源头污染、化学品污染等问题外，目前我国食品安全领域还存在贸易与技术壁垒。
陈国南介绍，中国农产品出口额由1996年的143.40亿美元增加到2012年的632.9亿美元，年均增长速度为9.7%。然而，中国仍然约有90%的农业出口企业受国外技术性贸易壁垒影响，每年损失百亿美元左右。
例如，对我国输出日本的大米和输出欧洲的茶叶，国外要求检测100多种农药残留而且要求的最高残留限量为目前先进检测方法的检测低限。在农药残留的检测中要求一次能进行上百种农药的多残留分析。这就要求我们提高自身的检测技术水平。陈国南表示，目前，现代分子生物学技术与信息科学的结合产生的新技术可显著提高食源性疾病的病原体监测和溯源能力，这一技术目前我们国家已经在发展，但与国际先进水平仍存在差距。
陈国南还认为，我国现有的食品安全技术措施与国际水平不一致的原因之一，就是没有广泛地应用危险性评估技术，特别是对化学性和生物性危害的暴露评估和定量危险性评估。如沙门氏菌、大肠杆菌O157:H7等致病菌对不同人群和个体的致病剂量尚不清楚;疯牛病与人的克-雅氏病之间的确切关系尚待阐明;国际上所报导的男性精子减少是否确与二噁英和氯丙醇等环境内分泌干扰物的暴露增加有关。
国际经验表明，实现从“农田到餐桌”的全过程管理，建立从源头治理到最终消费的监控体系对于保障食品安全十分重要。在这些方面，我国科学数据尚不充分，需要开展基础研究。
陈国南说，我国部分出口食品企业已应用了HACCP技术，但缺少覆盖各行业的HACCP指导原则和评价准则，从而需要制定这一先进技术的指导原则和评价准则，以便在我国广泛应用。
陈国南介绍，我国现行标准与国际不接轨，内容不完善，技术落后，实用性不强、特别是在有毒有害物质限量标准方面缺乏基础性研究，在创新性方面差距更加明显。许多产品标准没有充分利用“危险性评估”原则,考虑总暴露量在各食品中的分配状况，现行食品卫生标准的覆盖面不广。经常是国外设定一个技术壁垒后，我国有关部门才开始着手建立相关标准。这种被动的局面已经给我国农产品在国际市场上的形象和竞争力带来了很大的负面影响。因此，需要将危险性评估技术引进我国食品安全标准领域开展基础研究，以有利于我国农业产业和食品工业结构调整并促进市场竞争力。
