植物总DNA提取的必备的设备有：研钵、液氮罐、电热恒温水浴锅、小容量离心机、大容量离心机、冰箱、紫外分光光度计等。
二、PCR反应系统设备配置
一个实验室要能进行PCR反应实验，一般要具备以下实验设备：超净操作台、涡旋振荡器、小容量离心机和PCR仪。由于PCR技术的提高，其对环境的要求也有所降低，所以为了方便，许多人做PCR反应已不在无菌操台上进行了。尽管如此，超净操作台还是分子实验室必备的仪器，有不少实验是必须在超净操作台上进行的。
三、凝胶电泳及显色系统设备配置
凝胶电泳系统的主要功能是检测提取的总DNA质量及PCR扩增产物。整个过程的完成需电泳仪、电泳槽、微波炉、摇床、胶盆、灯箱、紫外灯和一些常规的小件工具。
四、凝胶成像及数据处理系统设备配置
为了能观察、记录实验过程、永久地保存实验结果以及对大量分子数据进行处理分析，凝胶成像、图像保存及数据处理系统是必不可少的。对于分子植物育种实验来说，分子数据的获得及分析是分子育种中非常核心的一步。只有对所得分子数据结合表型数据进行充分详实的分析，才能在实际育种中得到更有效的运用。这一系统主要包括凝胶成像系统、扫描仪、及各类生物应用软件。
五、其它的常规设备
分子生物学实验对实验操作环境及反应溶液的条件要求很高。首先，是实验用水的水质要好、纯度要高。大部分实验用水都要求是超纯水。因此必需配置纯水器和超纯水器。其次，是无菌环境。离心管、Tip头、一些配溶液的器皿以及不少溶液都必需灭菌消毒。因而高压灭菌锅和烘干箱也是分子实验室必不可少的。很多的实验过程要始终在无菌条件下进行，所以无菌操作台是不可或缺的。再者，是溶液的取样、pH值要精确，溶液纯度要高。故高精度的电子天平和pH计是配药时必备的仪器，而磁力加热搅拌器则是配的一个好帮手。还有移液器，它是一种精确取样的仪器，根据取样量的需要，可选择不同取样大小的移液器分子。这就需要有良好的冷藏系统，一般分子实验室要具备4℃、-20℃的冰箱，条件较好的最好有-70℃的超低温冰箱。
六、易耗品
