微生物有大市场
微生物制剂保健食品指采用微生物发酵工程来生产某些初级代谢产物、次级代谢产物，及利用生物体的某一组成部分或生物细胞本身制备的保健食品的统称。其研究内容也主要分为菌制剂、酶制剂和其他活性物质。
随着人们对于生命健康的愈发重视，以补充维生素、矿物质等为目的，具有调节机体功能，且不会对人体产生危害的保健食品，市场需求量一路攀升。这也从另一方面显示出保健食品市场的巨大成长空间和发展潜力，同时，也给微生物制剂保健食品敞开了一扇大门。
值得一提的是，紫杉醇、防御素以及红曲等活性物质，应用于保健食品表现出独特的功能和疗效。
据介绍，紫杉醇主要适用于卵巢癌，对肺癌、大肠癌、黑色素瘤等也都有一定疗效;小球藻表达的免疫防御素则具有广谱微生物抗性，对多种病毒、细菌、真菌都具有显著抗性;红曲是红曲霉菌经发酵而成，广泛应用于食品类、药品类、化妆品类，其产生的洛伐他汀还可以降脂降压。
另外，酶法合成功能性食品，如功能性低聚糖、功能性活性肽、海藻糖、淀粉糖等，也是国际食品科学和食品生物技术的前沿阵地，有巨大的市场潜力和广阔的发展空间。
微生物制剂待产业化
目前，微生物菌剂已经在诸多保健食品领域开发应用，例如乳酸菌及其发酵制品、乳糖酶等酶制剂、多不饱和脂肪酸、活性多糖、微量活性元素等。随着生物技术的发展，将有越来越多的微生物制剂广泛应用于食品工业，加大优质微生物制剂的开发及应用工艺的改进力度，已是大势所趋，当务之急。
促进我国微生物制造产品和农用生物制品的国产化和规模化，提升我国酶制剂、微生物发酵产品和农产品的质量，是为了有效保障我国的粮食安全，同时带动相关产业的技术进步和结构调整。
国家发改委对微生物制造和绿色农用生物制品两个专项的重点支持。其中，微生物制造专项的支持重点主要包括：新型酶制剂产业化――以酶工程技术和基因工程技术为基础，重点支持1000吨/年规模以上的新型半纤维素酶、脂肪酶、蛋白酶的产业化，以及酶制剂在造纸、纺织、制革中的产业化应用;新型微生物发酵产品――以微生物分子选育、代谢工程、发酵工程技术为基础，重点支持500吨/年规模以上的高附加值氨基酸、核苷，1000吨/年规模以上的高附加值有机酸和多元醇的产业化;生物制造工艺示范应用――以新型生物催化与转化技术为基础，重点支持年产万吨级氨基酸、年产百吨级手性医药中间体的生物制造工艺改造升级与示范。
农业微生物制剂产业化可保障食品安全
农业微生物制剂的研究与应用在我国现代农业的发展中具有重要意义，它与生物农药、生物饲料、生物保鲜等领域密切相关，在解决食品安全、生态安全中举足轻重。目前，我国农业生物制剂在产品研制、质量标准等诸多方面与发达国家存在相当差距。未来，以挖掘资源丰富的微生物，开发系列农用产品，服务于现代农业发展，无疑是一个富有挑战且潜力巨大的研发领域。
农业微生物制剂与食品安全的七大研究行动计划内容丰富，操作性强，有农业微生物功能菌株资源库构建，农业微生物发酵技术创新及工艺关键技术研发，畜禽健康养殖的微生物制剂产业化关键技术研发，作物健康栽培的微生物制剂产业化关键技术研发，农业环境污染治理的微生物制剂产业化关键技术研发，农业微生物制剂质量标准提升与环境安全评估和农产品中微生物毒素的检测监控技术创新。
另外，微生物制剂还可用于畜禽粪便治理及资源化再利用、污水处理生物增效、景观水体生态修复等，对于生态环保建设意义重大。
