基因芯片实验设计探讨
彼得•杜拉克 (Peter F. Drucker) 的名言「效率是把事情做对；效用是做对的事情」，基因芯片 (microarray) 数据结果能否发挥最大的效用在于一开始是否做了正确的实验设计，依研究目标进行分析，从中撷取最想看的结果并厘清疑虑。华联生技将介绍基因芯片实验设计的种类，继续为您的实验扮演最佳效率的角色。
基因芯片实验设计种类
一般而言，基因芯片实验设计须针对基因芯片重复性及生物性重复进行设计。以最佳的实验设计来说，三重复的基因芯片实验结果是从科学研究角度最具可信度的，因各种实验中所使用的试剂、仪器、环境、人..等各方面皆会使实验结果具有某种程度的量测不确定度，三重复的实验设计即是为了降低这些量测变异。但如因研究经费之限制或仍在寻找方向，亦可选择单片或双重复，先从茫茫的基因海中寻找出隐约的方向，如果方向是令人兴奋的，再考虑投入更多经费，进行更为严谨的多重复芯片验证实验。
生物重复性是指研究人员在收集生物样品时，可能因组织位置、个体差异、实验环境偏差…等导致同一条件的生物样品实验产生截然不同的结果。例如研究小鼠的肝脏基因差异，A老鼠与B老鼠即使是以相同条件饲养及用药，仍会有先天上的个体差异，意即A老鼠与B老鼠的肝脏基因表现不会完全相同；或是细胞培养的实验，A盘细胞与B盘细胞虽用相同的培养及用药条件，但可能两盘细胞在培养箱的位置不同，例如A盘细胞比较靠近温度、CO2、光源…等控制器附近，使得A盘细胞与B盘细胞的基因表现有差异。为了确认并降低这种个体差异，应进行生物重复性试验，即指多养几只老鼠或几盘细胞，每只老鼠或每盘细胞皆进行一次芯片实验，最后结果分析时只挑选在生物性重复内呈现相同趋势的基因。如果生物性重复的芯片结果差异太大，可能代表有不知名的因素干扰个体老鼠或细胞的生理或心理环境，需重新检查实验设计，并另做一次生物性重复实验。
华联生技针对常见的实验型态，将实验设计与分析归成六大种 ，
以上六種常見基因芯片实验设计详述如下
一次的芯片实验往往可以得到数以百笔的实验数据，若没有一开始就把实验设计好，很容易就会迷失在数据海中，造成时间与经费上的耗损却得不到好的结果。华联乐意与您分享超过十年的芯片实验设计经验，若有任何跟芯片实验相关的疑问，都欢迎与华联联络哟。
